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如果钓鱼岛发生冲突，决定战争胜负的不只是士兵的人数和武器装备，而且也包括能否高效发挥部队的作战能力、执行能力以及后勤保障等因素。民众的抵抗热情也是很重要的环节，开战后物价特别是依赖中国的蔬菜，粮食等硬通货价格会大幅度上涨。
曾经在日本陆上自卫队担任一等陆佐(上校)的参议员佐藤正久指出，对于离岛防卫和夺岛来说，后勤补给非常重要。那霸是离钓鱼岛最近的可供航空自卫队结集物资和人员的基地，但距离也有420公里，而可供海上自卫队使用的佐世保基地则相隔1100公里。“要在这样的距离范围内确保空路和海路的安全很难做到。”
钓鱼岛与中国本土最短的距离是300公里。一旦中国大量的舰船和战斗机控制了东海的“领海和领空”，那么日本的补给线就有可能被切断。
弹药供应不上也是一大问题。截至2011年3月末，自卫队共有弹药12.5万吨，而驻日美军仅在广岛的仓库里就储备了几乎相同数量的弹药，可见自卫队的准备并不充分。
维修和维护也是一大问题。虽然自卫队的反潜巡逻能力受到了普遍称赞，但如果缺乏维修的经费，其实力将大打折扣。此外，新型P-1巡逻机需要的维修费会更高。
还有人担心飞行与技术人员的短缺甚至会超过飞机数量的不足。如果东海发生战事，即使是局部战争，人民生活也会受到很大影响。
日本海上自卫队
首先，因停止从中国进口物资而导致的“衣食住”供应缺乏。根据日本财务省贸易统计，2013年从中国的进口总额约为18万亿日元，在整个进口中占比21.7%。日本若停止从中国进口产品，很多生活必需品在商店都会断货。
最新统计说日本的食材自给率为39%，其余部分依靠从国外进口，其中中国占比很高。
日本90%的石油靠从中东进口，大部分的天然气依靠从中东、澳大利亚和东南亚进口，一旦石油生命线停摆，后果不堪设想。
济产业省2012年的数据显示，目前在中国的日资企业有7700家，如果战事发生，日资企业遭受破坏或经营活动停止导致的经济损失会很大。
如果钓鱼岛发生冲突，朝鲜有可能趁乱作出南侵韩国的决定。届时日本和自卫队将会面临什么样的危险?文章称，“2015年朝鲜半岛有发生武力冲突的可能。为应对不知何时爆发的战争，必须做好万全准备。”
