彼得保罗要塞建在一座岛屿上，彼得大帝在涅瓦河三角洲上选择了这座小岛，作为抗敌前哨，整个圣彼得堡最初的建设，就是从这个小岛开始的，这个小岛名为“兔子岛”。
彼得大帝心中的城市，需要用石头建造，为此，他命令集中全国的石匠，并颁布石头税，让所有经过的船只、车队都要携带一定数量的建材。到1787年，所有要塞城墙全部换成石头建筑。
要塞的主要建筑是彼得保罗教堂，其钟楼高122.5米，教堂内安放着俄罗斯所有皇帝的陵墓，从彼得一世到十月革命前夕末代皇帝的陵墓。这座要塞建成后，并没有进行过战斗，而是成了一座监狱，用来关押政治犯。看到那1米多厚的砖墙，想着也不好越狱。
