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截至1999年9月底，共装备各型作战舰艇140艘，总吨位约35.8万吨，其中驱逐舰、护卫舰53艘18.3万吨，潜艇16艘3.9万吨，扫布雷舰艇32艘2.7万吨;各型飞机215架。
海上自卫队参谋部驻东京都。补给本部和中央通信队群驻东京都。
航空自卫队
编制定员4.7266万人，实有兵员4.5223万人。编有1个航空总队，下辖3个航空方面队(各辖两个战斗航空团)、1个航空混成团、6个防空导弹群;1个航空支援集团;1个航空教育集团(下辖2个训练航空团、3个飞行教育团);1个航空开发实验集团。
截至1999年3月底，共装备各型作战飞机498架，其中歼击机358架、侦察机26架、预警机7架、运输机59架。
航空自卫队参谋部驻东京都。
航空总队、航空支援集团司令部设在府中市。航空教育集团、航空开发实验集团司令部分别设在浜松市和狭山市。补给本部设在东京都。
