至此，韩日关系正常化谈判进入最后阶段。然而，韩国国内民众的反对声浪日益高涨。虽然谈判是秘密进行的，但有关韩国政府在谈判中做出重大让步的消息在民间越传越广。1964年6月，韩国上万名学生和市民走上街头举行抗议示威，强烈要求政府结束与日本进行的“行乞外交”。当时，朴正熙在汉城实施了约一个多月的戒严令。1965年6月22日，韩日正式在东京签署《韩日基本条约》以及涉及索赔权、渔业等方面的三项协定。同年8月14日，在反对党全体议员抵制投票的情况下，韩国国会以100票赞成，1票弃权的结果通过《韩日基本条约》。同年12月11日，日本国会批准该条约。
